Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/10889/11441
Title: Σύνθεση και βιολογική αξιολόγηση δυνητικά αντιβακτηριακών πεπτιδίων
Other Titles: Synthesis and biological evaluation of potential antibacterial peptides
Authors: Πλακαντωνάκη, Μαρία
Keywords: Λιποσώματα
Σύνθεση πεπτιδίων σε στερεά φάση
Κυκλικός διχρωισμός
Λιπιδικές μεμβράνες
Συστήματα τοξίνης-αντιτοξίνης
Keywords (translated): Εscherichia coli
Liposomes
Solid phase peptide synthesis
Circular dichroism
Lipid membranes
Toxin-antitoxin systems
Abstract: Τα βακτήρια μπορούν και επιβιώνουν κάτω από αντίξοες περιβαλλοντικές συνθήκες με διάφορους κυτταρικούς μηχανισμούς. Ένας από αυτούς είναι τα ενδογενή συστήματα τοξινών-αντιτοξινών που επιτρέπουν την επιβίωση των βακτηρίων σε εχθρικά περιβάλλοντα. Στην παρούσα διπλωματική εργασία, πραγματοποιήθηκε η σύνθεση και η in vitro αξιολόγηση των πεπτιδικών αναλόγων των τοξινών-αντιτοξινών MqsΑ, MqsR, HicA και RelE της Escherichia coli. Η σύνθεση των αναλόγων έγινε σε στερεά φάση επί της 2-χλωροτριτυλοχλωριδίου ρητίνης (CLTR-Cl), η οποία συνδυάζεται με την Fmoc/tBu μεθοδολογία, χρησιμοποιώντας τα Ν,Ν'-διισοπρoπυλοκαρβοδιιμίδιο/1-υδροξυβενζοτριαζόλιο (DIC/HOBt) ως αντιδραστήρια σύζευξης. Η Να ομάδα των αμινοξέων προστατεύτηκε με Fmoc, ενώ η πλευρική αλυσίδα του κάθε αμινοξέος προστατεύτηκε ως εξής: Arg(Pbf), Asn(Trt), Cys(Trt), Asn(Trt), Glu(tBu), His(Trt), Lys(Boc), Ser(tBu), Thr(tBu), Tyr(tBu). Ο έλεγχος της καθαρότητας των τελικών προϊόντων έγινε με υγρή χρωματογραφία υψηλής επίδοσης ανάστροφης φάσης (RP-HPLC) και η ταυτοποίησή τους με φασματομετρία μάζας (ESI-MS). Την σύνθεση ακολούθησε in vitro αξιολόγηση των πεπτιδίων. Μελετήθηκε η δευτεροταγής δομής των τεσσάρων πεπτιδικών αναλόγων με φασματομετρία κυκλικού διχρωισμού και εξετάστηκε και η αλληλεπίδραση τους με λιπιδικές μεμβράνες λιποσωμάτων.
Abstract (translated): Bacteria survive environmental changes by employing a remarkable umber of cell mechanisms. One of these is endogenous system of toxins-antitoxins that may allow the survival of bacteria in hostile environments. In this thesis, peptide analogues from the toxins/antitoxins MqsΑ, MqsR, HicA and RelE of Escherichia coli were synthesized and their in vitro properties examined. The synthesis of these analogues was achieved using 2-chlorotritylchloride resin (CLTR-Cl), which is combined with Fmoc/tBu methodology, using DIC/HOBt as coupling reagents. The Nα group of amino acids was protected with Fmoc and the side chain of each amino acid was protected as following: Arg(Pbf), Asn(Trt), Cys(Trt), Asn(Trt), Glu(tBu), His(Trt), Lys(Boc), Ser(tBu), Thr(tBu), Tyr(tBu) . The purity of final products was verified by Reversed-Phase High Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC) and their identification was achieved by mass spectrometry (ESI-MS). Peptide synthesis and purification was followed by in vitro evaluation of the peptides. Their secondary structure was studied by circular dichroism spectroscopy and their interaction with lipid membranes of liposomes was also examined.
Appears in Collections:Τμήμα Χημείας (ΜΔΕ)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Maria Plakantonaki master thesis.pdf3.22 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.