Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/10889/9804
Title: DrugeVar : βάση δεδομένων συσχέτισης φαρμάκων, γονιδίων και γενετικών βιοδεικτών για την κλινική φαρμακογενωμική
Other Titles: DruGeVar : an online resource triangulating drugs with genes and genomic biomarkers for clinical pharmacogenomics
Authors: Κομιανού, Αγγελική
Keywords: Φαρμακογενωμική
Φαρμακογενωμικοί βιοδείκτες
Δεδομένα μεγάλου όγκου
Οπτικοποίηση
Keywords (translated): Pharmacogenomics
Pharmacogenomics biomarkers
DrugeVar database
Big data
Visualization
AngularJS
D3.js
Javascript infovis toolkit
SASS
Grunt
Unit testing
End-to-end testing
Jasmine
Protractor
Abstract: Σκοπός της διπλωματικής εργασίας είναι η ανάπτυξη εργαλείου φαρμακογενωμικής, το οποίο συλλέγει δεδομένα από πολλαπλές βάσεις δεδομένων και τα αναπαριστά με διαδραστικό τρόπο. Η πληροφορία, η οποία συλλέχθηκε, εστιάζει στην προβολή των οντοτήτων: γονίδια, φαρμακογενωμικοί βιοδείκτες και φάρμακα, καθώς και στις συσχετίσεις μεταξύ τους, και οι οποίες επηρεάζουν την αντίδραση του ασθενούς κατά τη λήψη φαρμακευτικών ουσιών. Το εργαλείο που αναπτύχθηκε, και το οποίο βασίζεται στη βάση δεδομένων με την ονομασία DrugeVar Database, έχει ως σκοπό τη διαδραστική προβολή των πληροφοριών των τριών οντοτήτων και την ανάδειξη των αλληλοεξαρτήσεών τους εστιάζοντας κυρίως στην οντότητα των φαρμακογενωμιικών βιοδεικτών, η οποία αποτελεί τον συνδετικό κρίκο ανάμεσα στις υπόλοιπες δύο. Η ανάπτυξη της εφαρμογής οπτικοποίησης των δεδομένων αποτελείται από δύο περιβάλλοντα. Η αρχική υλοποίηση πραγματοποιήθηκε με χρήση των εργαλείων Microsoft Pivot Viewer και Silverlight και στοχεύει στη μαζική αναπαράσταση των δεδομένων, το φιλτράρισμα και ταξινόμησή τους. Η δεύτερη υλοποίηση, η οποία αποτελεί βασικό κομμάτι της παρούσας διπλωματικής εργασίας, αναπτύχθηκε με χρήση των εργαλείων AngularJS, D3,js και third party βιβλιοθηκών οπτικοποίησης και στοχεύει στην ανάδειξη των αλληλεξαρτήσεων των οντοτήτων.
Abstract (translated): The aim of this thesis is the development of a pharmacogenomics tool, which collect data from multiple databases and represent them interactively. The information that was collected, focuses on the entities: genes, pharmacogenomics biomarkers and drugs, as well as the correlations between them and which affect the patient's reaction when taking drugs. The tool, that was developed, that is based on the database called DrugeVar Database, aims at the interactive viewing of the three entities of information, highlighting their relations and focuses mainly on the entity of pharmacogenomics biomarkers which is the link between the other two. The development of the visualization application is divided into two environments. The initial implementation was performed using Microsoft Pivot Viewer and Silverlight tools and aimed at the massive representation of the data, its filtering and classification. For the second implementation, which is the main part of the current diploma thesis, we used AngularJS tools, D3.js and third party visualization libraries and aims at highlighting the relation of the entities.
Appears in Collections:Τμήμα Ιατρικής (ΜΔΕ)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
komianou-angeliki-pez-diploma-thesis-2016.pdf4.31 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.